MTs Muhammadiyah 4 Tawangharjo didirikan pada Tahun 1993. MTs Muhammadiyah 4 Tawangharjo berdiri atas prakarsa beberapa tokoh Muhammadiyah diantara yaitu: Drs. H. Moh. Anshor (Glesung, Baturetno), Abdul Kohar, S.Ag. (Selorejo, Sirnoboyo), Sudjadi, S.Ag. (Ngrakung Kulon, Tawangharjo), Tohar, A.Ma (Selorejo, Sirnoboyo), Marmin, S.Ag. (Platar, Platarejo), Marlan (Kepala Desa Sirnoboyo), Katimin, B.A. (Platar, Platarejo), Drs. Sadino (Platar, Platarejo) dan didukung oleh Pengurus PCM Kecamatan Giriwoyo.
Saat pertama kali didirikan, gedung yang digunakan masih menumpang dengan MI Muhammadiyah Tawangharjo selama kurang lebih 2 tahun (siswa masuk siang hari), yang berlokasi di tengah Dusun Ngrakung, Desa Tawangharjo. Pada tahun 1995 mulai menempati gedung sendiri secara bertahap, awalnya kelas 3 dan tahun berikutnya baru kelas 1 dan 2 seiring selesainya pembangunan 2 ruang kelas. Gedung MTs Muhammadiyah 4 Tawangharjo yang baru beralamat di Jl. Simpang Lima Dringo, Dusun Ngrakung, Desa Tawangharjo, Kecamatan Giriwoyo, Pada tahun 1995 MTs Muhammadiyah 4 Tawangharjo secara resmi memperoleh Ijin Operasional (Ijob) dari Kanwil Departemen Agama Propinsi Jawa Tengah.
Pada awal kepindahannya, dikarenakan ruangan masih terbatas dan tidak mencukupi, ruang kantor guru dan ruang kelas 1 menempati rumah milik Bapak H. Abdul Kohar, S.Ag yang berada diseberang jalan dekat sekolah yang difungsikan untuk ruang kantor dan ruang kelas sampai dengan tahun 2002. Baru pada tahun 2003 seluruh siswa menempati bangunan sekolah sendiri. Saat ini bangunan MTs Muhammadiyah 4 Tawangharjo berdiri diatas lahan seluas 1.508 m2. Seiring dengan perkembangannya tentu dilalui oleh pelaku sejarah yang silih berganti, adapun pimpinan atau kepala madarasah yang pernah menjabat di MTs Muhammadiyah 4 Tawangharjo sebagai berikut :
| NO. | NAMA | PERIODE |
| 1 | Drs. H. Moh. Anshor | 1 Juli 1993 – 30 Juni 2007 |
| 2 | H. Abdul Kohar, S.Ag. | 1 Juli 2007 – 30 Juni 2009 |
| 3 | Sadi Ihsanto, S.Pd. | 1 Juli 2009 – 30 Juni 2014 |
| 4 | R. Ari Wibawa, S.E. | 1 Juli 2014 – Sekarang |